По окрасу волосяного покрова нутрий подразделяют на стандартных и цветных. Стандартные нутрии имеют коричневую (бурую) окраску волосяного покрова различных оттенков - от светло-коричневой до черно-коричневой и красноватой. У большинства стандартных нутрий волосяной покров имеет темно-коричневый цвет. Стандартные нутрии отличаются хорошим здоровьем и высокой плодовитостью - в среднем 5,5 щенка в помете. Все цветные нутрии по признаку наследования окраски волосяного покрова подразделяются на две группы: доминантные и рецессивные. К первой группе относятся белые азербайджанские, золотистые и черные нутрии, ко второй группе - кремовые, соломенные, альбиносы, белые северные, дымчатые, а также завезенные из Италии - бежевые, перламутровые, розовые и белые итальянские. При скрещивании доминантных нутрий со стандартными уже в первом поколении часть потомков имеет окрас, характерный для цветных нутрий. При скрещивании со стандартными нутриями рецессивных отечественных нутрий в первом поколении потомство имеет окрас стандартных нутрий, а от рецессивных нутрий, завезенных из Италии,-серебристую окраску. При разведении помесей первого поколения по одному и тому же окрасу в потомстве наблюдается расщепление: от отечественных форм рождается 25% цветных и 75% стандартных, от итальянских - 25% цветных, 50% серебристых и 25 % стандартных. При скрещивании помесей первого поколения с исходной цветной родительской формой в потомстве рождается от отечественных зверей 50% цветных и 50% стандартных (от отечественных) или серебристых (от итальянских) щенков.
Белые азербайджанские нутрии. Признаны новой породной группой и рекомендуются для промышленного разведения. Имеют чисто-белый окрас остевых и пуховых волос и лишь у некоторых особей имеется пигментация вокруг глаз, ушей, на огузке и у корня хвоста, общей площадью до 10%. Плодовитость при разведении в себе в среднем 4,6 щенка, при спаривании со стандартными самками около 5 щенков в помете. При разведении в себе среди потомства первого поколения получается две трети белых щенков и одна треть стандартных, а при скрещивании со стандартными - по 50% цветных и стандартных.
Золотистые нутрии. По размеру и живой массе не уступают стандартным. Окрас волосяного покрова яркий, золотистый, более светлый на брюшке. Плодовитость несколько понижена - при разведении в себе 3,3-3,7 щенка, при спаривании золотистых самцов со стандартными самками плодовитость повышается до 4,8-5,1 щенка. При разведении в себе потомства первого поколения получается две трети щенков золотистых и одна треть стандартных, а при спаривании со стандартными 50% цветных и 50% стандартных.
Черные нутрии. Завезены из Канады в 1966 и 1968 гг. В волосяном покрове черных нутрий остевые полосы сплошь черные, а подпушь темно-серая. При разведении в себе в потомстве первого поколения получается 67% черных щенков и 33% стандартных. Расщепление З(черные) : 1(стандартные). Плодовитость высокая - при разведении в себе в среднем 5 щенков.
Кремовые нутрии. Волосяной покров кремового окраса, более темный на спине и светлый на брюшке. Кожа на носу коричневая, глаза вишневого цвета. Средняя плодовитость при разведении в себе 3,8 щенка. При разведении в себе все потомство получается с кремовым окрасом, а при спаривании со стандартными нутриями все щенки имеют стандартный окрас. Волосяной покров в возрасте более 6 месяцев приобретает нежелательные буроватые оттенки, вследствие чего к разведению в хозяйствах не рекомендуются.
Белые итальянские нутрии. Завезены из Италии в 1958 г. Волосяной покров белый без пигментных пятен. Подпушь и кроющие волосы имеют легкий кремовый оттенок. Глаза коричневые. При спаривании со стандартными нутриями все первое поколение щенков получается с серсористым волосяным покровом. Средняя плодовитость при разведении в себе 4,7 щенка, а при спаривании со стандартными нутриями 5 щенков. Все остальные цветные группы нутрий имеют низкую плодовитость и другие недостатки и поэтому для разведения в личных подсобных и фермерских хозяйствах не рекомендуются.